水污染连续自动监测系统是由若干个水污染固定监测站（可设在河流两岸、湖泊和水库的出入口、工厂废水排出口、污水处理厂排水口等处）、数据通信系统和一个监测中心三部分组成。监测站有连续采样装置、水污染连续监测仪器、水文气象参数测定仪器以及水样存贮装置等。各监测站连续测出的数据，经有线电或无线电通信系统定时地（例如每小时一次）传送至监测中心。监测中心设有电子计算机和各种外围设备，以收集数据、处理数据及存贮数据，并可向各监测站发出遥控指令。如某一固定监测站的污染度指标超过控制值时，立即指令该站的采样装置启动，采集并存贮此时的水样，以便进行试验室分析。
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